ביה”ס אל-מותנבי חרט על דגלו הטמעה של ערכים הדוגלים בחינוך משמעותי – שיוויוני – חדשני – מתקדם. ביה”ס שם לו למטרה הקניית מיומנויות חברתיות חינוכיות המשלבות למידה איכותית השואפת למצויינות ולמיצוי יכולתו של הפרט. ביה”ס רואה בכל תלמיד לומד עצמאי בעל סגולות אישיות ראויות לטפוח ולקידום תוך גדי שמירה על כבוד הדדי ודיאלוג בין הגורמים הרלוונטיים, תלמידים מורים והורים ומתוך תחושבת מחוייבות ואחריות לתפיסת עולמו של ביה”ס.